Η Αθηνά Παναγιωτοπούλου έχει διδάξει σε δημόσια σχολεία της Δευτεροβάθμιας Εκπαίδευσης (2005 - 2008) και συμμετείχε σε ερευνητικά προγράμματα του Κέντρου Ελληνικής Γλώσσας (ΚΕΓ). Εντάχθηκε στο δυναμικό του Αμερικανικού Κολλεγίου Ελλάδος – Pierce το 2013. Στο πλαίσιο των καθηκόντων της, υπήρξε Σύμβουλος εκδόσεων του ελληνικού περιοδικού «Φωτεινές Ημέρες» (2017-2019). Από τον Σεπτέμβριο του 2021 είναι βοηθός επικεφαλής του Φιλολογικού Τμήματος. 
Είναι παντρεμένη και μητέρα τριών αγοριών.