Ο Κωνσταντίνος Αμπατζής ανήκει στο εκπαιδευτικό προσωπικό του Pierce – Αμερικανικό Κολλέγιο Ελλάδος και έχει διδάξει Φυσική στο Γυμνάσιο και στο Λύκειο από το 2005. Για αρκετά χρόνια έχει υπάρξει υπεύθυνος του εργαστηρίου Φυσικής, υπεύθυνος του Ομίλου Πυρηνικής Φυσικής και συντονιστής των Ομίλων Δραστηριοτήτων του Pierce.
Ο Κωνσταντίνος Αμπατζής έχει υπηρετήσει από το 2010 έως το 2014 ως Σύμβουλος Μαθητικών Κοινοτήτων του Γυμνασίου και από το 2014 έως το 2018 ως επικεφαλής του τμήματος Φυσικών Επιστημών. Από τον Ιούλιο του 2018 έως και σήμερα υπηρετεί ως Υποδιευθυντής του Λυκείου.
Έχει συμμετάσχει σε πολλά επιστημονικά συνέδρια, ημερίδες και επιμορφώσεις σχετικές με εκπαιδευτική διοίκηση, διδακτικές μεθόδους, αναλυτικά προγράμματα, μαθησιακές δυσκολίες, διαχείριση τάξης, εκπαιδευτική αξιολόγηση και διαφοροποιημένη μάθηση.
Επίσης, έχει συγγράψει τρία βιβλία Φυσικής για το Γυμνάσιο και το Λύκειο (Εκδόσεις Έναστρον).